MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis KF147 chromosome

Total Repeats: 50082

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013656	CAG	2	6	629	634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281490499
2	NC_013656	T	7	7	658	664	0 %	100 %	0 %	0 %	281490499
3	NC_013656	TGTC	2	8	684	691	0 %	50 %	25 %	25 %	281490499
4	NC_013656	CTTG	2	8	712	719	0 %	50 %	25 %	25 %	281490499
5	NC_013656	A	6	6	731	736	100 %	0 %	0 %	0 %	281490499
6	NC_013656	ATT	2	6	738	743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281490499
7	NC_013656	A	6	6	746	751	100 %	0 %	0 %	0 %	281490499
8	NC_013656	CGG	2	6	771	776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	281490499
9	NC_013656	GAT	2	6	796	801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281490499
10	NC_013656	ATG	2	6	822	827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281490499
11	NC_013656	AACTG	2	10	832	841	40 %	20 %	20 %	20 %	281490499
12	NC_013656	AATC	2	8	860	867	50 %	25 %	0 %	25 %	281490499
13	NC_013656	AGC	2	6	879	884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281490499
14	NC_013656	GCA	2	6	989	994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281490499
15	NC_013656	TTGCTG	2	12	996	1007	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	281490499
16	NC_013656	TATT	2	8	1035	1042	25 %	75 %	0 %	0 %	281490499
17	NC_013656	TGG	2	6	1045	1050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281490499
18	NC_013656	ATGC	2	8	1076	1083	25 %	25 %	25 %	25 %	281490499
19	NC_013656	TGAC	2	8	1101	1108	25 %	25 %	25 %	25 %	281490499
20	NC_013656	TTC	2	6	1135	1140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281490499
21	NC_013656	A	6	6	1177	1182	100 %	0 %	0 %	0 %	281490499
22	NC_013656	AAT	2	6	1358	1363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	281490499
23	NC_013656	ACT	2	6	1403	1408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281490499
24	NC_013656	GATT	2	8	1516	1523	25 %	50 %	25 %	0 %	281490499
25	NC_013656	A	6	6	1633	1638	100 %	0 %	0 %	0 %	281490499
26	NC_013656	A	7	7	1673	1679	100 %	0 %	0 %	0 %	281490499
27	NC_013656	ATT	2	6	1698	1703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281490499
28	NC_013656	TTG	2	6	1725	1730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281490499
29	NC_013656	TGG	2	6	1831	1836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281490499
30	NC_013656	CA	3	6	1844	1849	50 %	0 %	0 %	50 %	281490499
31	NC_013656	TAA	2	6	2116	2121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	281490500
32	NC_013656	TTGAAG	2	12	2205	2216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281490500
33	NC_013656	T	6	6	2266	2271	0 %	100 %	0 %	0 %	281490500
34	NC_013656	ATA	2	6	2280	2285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	281490500
35	NC_013656	GCT	2	6	2333	2338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281490500
36	NC_013656	AGA	2	6	2674	2679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281490500
37	NC_013656	ATCA	2	8	2716	2723	50 %	25 %	0 %	25 %	281490500
38	NC_013656	ATG	2	6	2748	2753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281490500
39	NC_013656	AAG	2	6	2754	2759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281490500
40	NC_013656	TTA	2	6	2815	2820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281490500
41	NC_013656	TTGA	2	8	2828	2835	25 %	50 %	25 %	0 %	281490500
42	NC_013656	TGC	2	6	2905	2910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281490500
43	NC_013656	TTG	2	6	2942	2947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281490500
44	NC_013656	GTA	2	6	2999	3004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281490500
45	NC_013656	AGGT	2	8	3024	3031	25 %	25 %	50 %	0 %	281490500
46	NC_013656	GAA	2	6	3041	3046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281490500
47	NC_013656	AAG	2	6	3063	3068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281490500
48	NC_013656	TGAT	2	8	3105	3112	25 %	50 %	25 %	0 %	281490500
49	NC_013656	GAA	2	6	3194	3199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281490500
50	NC_013656	GTAC	2	8	3227	3234	25 %	25 %	25 %	25 %	281490500
51	NC_013656	AAATTA	2	12	3235	3246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	281490500
52	NC_013656	TA	3	6	3357	3362	50 %	50 %	0 %	0 %	281490501
53	NC_013656	GAA	2	6	3410	3415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281490501
54	NC_013656	A	7	7	3420	3426	100 %	0 %	0 %	0 %	281490501
55	NC_013656	TTA	2	6	3436	3441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281490501
56	NC_013656	CTT	2	6	3450	3455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281490501
57	NC_013656	GAAA	2	8	3475	3482	75 %	0 %	25 %	0 %	281490501
58	NC_013656	GCA	2	6	3512	3517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281490501
59	NC_013656	TTA	2	6	3556	3561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281490501
60	NC_013656	ACA	2	6	3584	3589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281490501
61	NC_013656	CAG	2	6	3606	3611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281490501
62	NC_013656	GAG	2	6	3640	3645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281490501
63	NC_013656	AGA	2	6	3655	3660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281490501
64	NC_013656	CTG	2	6	3690	3695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281490501
65	NC_013656	T	6	6	3697	3702	0 %	100 %	0 %	0 %	281490501
66	NC_013656	A	6	6	3790	3795	100 %	0 %	0 %	0 %	281490501
67	NC_013656	GAA	2	6	3812	3817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281490501
68	NC_013656	ACT	2	6	3840	3845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281490501
69	NC_013656	GTC	2	6	3867	3872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281490501
70	NC_013656	GAA	2	6	3947	3952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281490501
71	NC_013656	TGA	2	6	4012	4017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281490501
72	NC_013656	AAAT	2	8	4203	4210	75 %	25 %	0 %	0 %	281490501
73	NC_013656	CTG	2	6	4212	4217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281490501
74	NC_013656	A	6	6	4293	4298	100 %	0 %	0 %	0 %	281490501
75	NC_013656	T	6	6	4312	4317	0 %	100 %	0 %	0 %	281490501
76	NC_013656	TAG	2	6	4335	4340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281490501
77	NC_013656	GCT	2	6	4349	4354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281490501
78	NC_013656	GAAA	2	8	4369	4376	75 %	0 %	25 %	0 %	281490501
79	NC_013656	AAG	2	6	4413	4418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281490501
80	NC_013656	T	6	6	4448	4453	0 %	100 %	0 %	0 %	281490501
81	NC_013656	AAT	2	6	4478	4483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	281490501
82	NC_013656	GAT	2	6	4493	4498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281490501
83	NC_013656	TCT	2	6	4507	4512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281490501
84	NC_013656	TGA	2	6	4543	4548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281490501
85	NC_013656	A	7	7	4603	4609	100 %	0 %	0 %	0 %	281490501
86	NC_013656	A	6	6	4725	4730	100 %	0 %	0 %	0 %	281490501
87	NC_013656	A	7	7	4735	4741	100 %	0 %	0 %	0 %	281490501
88	NC_013656	T	6	6	4902	4907	0 %	100 %	0 %	0 %	281490501
89	NC_013656	TGA	2	6	4909	4914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281490501
90	NC_013656	TTA	2	6	4946	4951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281490501
91	NC_013656	TGT	2	6	4999	5004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281490501
92	NC_013656	TTG	2	6	5025	5030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281490501
93	NC_013656	TAA	2	6	5041	5046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	281490501
94	NC_013656	AT	3	6	5047	5052	50 %	50 %	0 %	0 %	281490501
95	NC_013656	GAA	2	6	5120	5125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281490501
96	NC_013656	ATCA	2	8	5135	5142	50 %	25 %	0 %	25 %	281490501
97	NC_013656	AAC	2	6	5143	5148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281490501
98	NC_013656	TGA	2	6	5149	5154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281490501
99	NC_013656	TGT	2	6	5179	5184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281490501
100	NC_013656	A	7	7	5193	5199	100 %	0 %	0 %	0 %	281490501
101	NC_013656	CTTT	2	8	5213	5220	0 %	75 %	0 %	25 %	281490501
102	NC_013656	ATT	2	6	5305	5310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281490501
103	NC_013656	A	6	6	5328	5333	100 %	0 %	0 %	0 %	281490501
104	NC_013656	TTC	2	6	5334	5339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281490501
105	NC_013656	A	6	6	5340	5345	100 %	0 %	0 %	0 %	281490501
106	NC_013656	AAG	2	6	5349	5354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281490501
107	NC_013656	TTG	2	6	5433	5438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281490501
108	NC_013656	GAA	2	6	5444	5449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281490501
109	NC_013656	A	7	7	5448	5454	100 %	0 %	0 %	0 %	281490501
110	NC_013656	TGA	2	6	5455	5460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281490501
111	NC_013656	T	6	6	5469	5474	0 %	100 %	0 %	0 %	281490501
112	NC_013656	A	6	6	5520	5525	100 %	0 %	0 %	0 %	281490501
113	NC_013656	TAT	2	6	5526	5531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281490501
114	NC_013656	AAG	3	9	5757	5765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281490501
115	NC_013656	TGA	2	6	5785	5790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281490501
116	NC_013656	ATG	2	6	5811	5816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281490501
117	NC_013656	AGA	2	6	5881	5886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281490501
118	NC_013656	AGAC	2	8	5894	5901	50 %	0 %	25 %	25 %	281490501
119	NC_013656	TGA	2	6	5932	5937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281490501
120	NC_013656	AGT	2	6	5960	5965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281490501
121	NC_013656	GAA	2	6	6024	6029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281490501
122	NC_013656	TCT	2	6	6050	6055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281490501
123	NC_013656	ATT	2	6	6057	6062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281490501
124	NC_013656	AAG	2	6	6162	6167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281490501
125	NC_013656	A	6	6	6180	6185	100 %	0 %	0 %	0 %	281490501
126	NC_013656	TTTA	2	8	6198	6205	25 %	75 %	0 %	0 %	281490501
127	NC_013656	ATCA	2	8	6239	6246	50 %	25 %	0 %	25 %	281490501
128	NC_013656	ATG	2	6	6288	6293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281490501
129	NC_013656	A	7	7	6349	6355	100 %	0 %	0 %	0 %	281490501
130	NC_013656	AAG	2	6	6372	6377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281490501
131	NC_013656	TGAA	2	8	6399	6406	50 %	25 %	25 %	0 %	281490501
132	NC_013656	ATGA	2	8	6563	6570	50 %	25 %	25 %	0 %	281490501
133	NC_013656	AATTGA	2	12	6776	6787	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	281490502
134	NC_013656	A	7	7	6812	6818	100 %	0 %	0 %	0 %	281490502
135	NC_013656	GCA	2	6	6819	6824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281490502
136	NC_013656	A	7	7	6857	6863	100 %	0 %	0 %	0 %	281490502
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400	NC_013656	AAG	2	6	19177	19182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281490512
401	NC_013656	TCAA	2	8	19230	19237	50 %	25 %	0 %	25 %	281490512
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404	NC_013656	TAA	2	6	19406	19411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	281490512
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